CGView Server:基因组绘图及环形基因组可视化比较工具

摘 要:

CGView是一种比较基因组工具,可用于比较细菌、质粒、线粒体、叶绿体等环形基因组序列,能够在分析生成的结果中可视化展示基因组序列的特征信息。CGView Server首先利用BLAST进行基因组序列的比较,然后将比较结果和特征性分析信息转换为高质量的图形形式,对感兴趣的序列图形可以放大显示。

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CGView是一种比较基因组工具,可用于比较细菌、质粒、线粒体、叶绿体等环形基因组序列,能够在分析生成的结果中可视化展示基因组序列的特征信息。基因组序列格式可以为FASTA、GenBank、EMBL或单纯的原始形式(raw format)。将一个基因组序列提交到CGView Server后,可以再提交最多三个基因组序列进行比较分析。CGView Server首先利用BLAST进行基因组序列的比较,然后将比较结果和特征性分析信息转换为高质量的图形形式,对感兴趣的序列图形可以放大显示。对于BLAST比较的具体参数和结果显示形式可以通过选项参数的方法进行控制。

CGView Server:基因组绘图及环形基因组可视化比较工具

服务器地址:http://stothard.afns.ualberta.ca/cgview_server/

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