古细菌的16S rRNA分析引物选择

摘 要:

古细菌是一类很特殊的细菌,同时具有原核生物和真核生物的某些特征,多生活在一些极端的生态环境中,具有代表性的古细菌有极端嗜热菌、极端噬盐菌、极端嗜酸菌、产甲烷菌、嗜热菌、噬盐菌等。根据文献检索,证实古细菌的16S rRNA分析时,引物对519F/915R和344F/915R对于古细菌的特异性最好。

关键词: , ,

细菌(archaebacteria)又叫古生菌、古菌,是一类很特殊的细菌,同时具有原核生物和真核生物的某些特征。古细菌多生活在一些极端的生态环境中,它们代表了生命的极限,确定了生物圈的范围。古细菌和真细菌、真核生物一起,构成了生物的三域系统。古细菌分为泉古菌、广古菌、初古菌和纳古菌。具有代表性的古细菌有极端嗜热菌、极端噬盐菌、极端嗜酸菌、产甲烷古菌、嗜热菌、噬盐菌等。

根据文献中常用的古菌引物,在Silva数据库中搜索,对古细菌的16S rRNA测序引物进行分析比较,结果如下图所示。在所有搜索结果中,引物对519F/915R和344F/915R对于古细菌的特异性最好。对于Illumina MiSeq 2×300 bp的测序平台,引物519F/915R最适合;而引物344F/915R则更适合于Roche 454测序平台。

古细菌的16S rRNA分析引物选择

古细菌的16S rRNA分析引物选择

古细菌不同引物对搜索结果

    A+

除注明外,本站内容由 细菌之家 原创或整理,转载请注明出处及链接。

本文永久链接: http://www.bacteria.cn/html/2017/1971.html

  • 请您留言:专业水平所限,谬误之处在所难免。如您发现不正之处,请在下面留言,谢谢!

目前评论:1   其中:访客  1   博主  0

  1. avatar 老实人

    请问这篇古菌引物选择的文章是否有参考文献?都是哪几篇呢?

评论加载中...

发表评论

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen:

图片 表情