用分离芯片(ichip)高通量原位分离培养土壤中的不可培养微生物

摘 要:

目前环境微生物中只有非常小部分可以用人工培养基进行培养,而绝大部分都不可人工培养。rRNA和宏基因组研究表明,这些不可培养的微生物具有很大的多样性,可能是地球上最大的未知生物宝库。美国的科研人员开发了一种新的高通量平台用于大量培养和分离环境中的不可人工培养微生物,这种平台称之为分离芯片(isolation chip,ichip)。

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微生物研究中一直以来都未解决的一个问题是只有非常小部分的微生物可以在人工培养基中培养,而绝大部分都是不可人工培养的。rRNA和宏基因组研究表明,这些不可培养的微生物具有很大的多样性,可能是地球上最大的未知生物学宝库,这也激发了人们对它们的兴趣。

美国的科研人员建立了一种环境微生物的扩散室(diffusion chambers)原位培养方法,通过这种方法,可以使环境中自然存在的生长因子扩散到培养室,从而进行细菌培养。在此基础上,科研人员开发了一种新的高通量平台用于大量培养和分离环境中的不可人工培养微生物,这种平台称之为分离芯片(isolation chip,ichip)。Ichip由数百个微型扩散室组成,每个室可接种单个的环境细菌。通过这种方法,使人们研究那些不能人工培养微生物成为可能。

这种方法的合理性在于,可以使将一些自然生长因子通过扩散进入到培养室内,从而有助于培养室内的细菌生长。结果表明,通过这种方法分离到的细菌大大超过了标准分离方法得到的细菌。

参考文献:

Nichols D, et al. Use of ichip for high-throughput in situ cultivation of “uncultivable” microbial species. Appl. Environ. Microbiol. 2010,76, 2445–2450.

    日期:2015年03月05日  分类:其 它
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