细菌的双命名法规则与命名方式

摘 要:

细菌的科学命名原则也采用国际通用的双命名法和优先律原则。细菌的命名方式包括双命名法和三命名法。双命名法是由一个属名和一个种名构成,还可以包含命名人和年份等信息。三命名法是在双命名法的基础上,再加上亚种或变种的命名。要更好的理解细菌命名方式,需要了解细菌属、种、亚种、变种、菌群、菌株和菌型等概念。

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在对细菌进行科学分类的基础上,给予每种细菌一个科学名称,使之在生产实践、临床实践和科学研究中相互交流成为可能。按照国际标准的细菌命名法规,能保证所有科研工作者以相同的方式给予细菌命名,而尽可能的避免“异菌同名”或“同菌异名”。

1、物种的双命名法

双命名法(binominal nomenclature)又称二项式命名法,是瑞典植物学家林奈的一大贡献,即每一物种都给以一个统一的学名,并分成两个部分,由两个拉丁化名词所组成,第一个代表属名,第二个代表种名。为便于交流,双命名的物种之后还常常附带命名者的姓氏及命名的年份。

2、命名的“优先律”原则

在信息闭塞时代,两个或多个物种的“异物同名”或“同物异名”时有发生。为此,分类学家成立了专门分类委员会以定期交流并发布物种信息,还规定了物种命名的“优先律”。即对于“异物同名”者或“同物异名”者,均核定最早的命名对象不变,同物异名的其他名字则废除,异物同名的其他的同名物种则另取新名。“优先律”对于稳定生物学名发挥了十分重要的作用。动、植物命名的优先律分别于1758年、1820年起始实施。细菌命名的优先率直至1980年1月1日方开始实施。

在细菌领域,尽管1980实施优先律,“异菌同名”或“同菌异名”现象仍然非常常见。其中一个重要原因在于原核生物种群数量非常庞大,其在肉眼状态下又不能观察,能获得的信息量相对较少。

3、细菌的双命名法

细菌的科学名称(学名)的命名法也采用林奈的双命名法。具备拉丁化方案的形式和明确的分类等级两个特点,即由一个属名和一个种名构成。除此之外,双命名法还可以包括定名人和年份等信息。

细菌的双命名法可以包含5部分内容:

(1)属名:首字母大写,其余小写,斜体字;

(2)种名:小写,斜体字;

(3)首次定名人:正体字,用括号;

(4)现在定名人:正体字;

(5)定名年份。

如:

大肠杆菌Escherichia coli (Migula) Csatellani et Chalmers 1919;

枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis (Ehrrnbeg) Cohn 1872。

细菌学名的中文译名正好与英文命名相反:种名在前,属名在后。如:

Mycobecterium tuberculosis翻译为:结核分枝杆菌

Salmonella typhi翻译为:伤寒沙门氏菌

4、细菌的三命名法

细菌的三命名法是在双命名法的基础上,再加上亚种或变种的命名,通常是按如下形式命名:

属名+种名+(subsp.或var.)+亚种(变种)加词。

如:

苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种:Bacillus thuringiensis subsp. galleria;

酿酒酵母椭圆变种:Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus

对于未完成鉴定的菌种,种名可用sp.(species的缩写,单数)或spp.(复数)表示,均用正体。

对于亚种以下(包括亚种)的分类名词,通常不受国际命名法规的限制。

5、一些细菌命名相关的基本概念

(1)属:表示该微生物主要特征的名词,常代表微生物的主要特征,如形态(芽孢杆菌属、葡萄球菌属)、生理(乳杆菌属)等。

(2)种:最基本的分类单位,种是一群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。

(3)亚种:进一步细分种时所用的单元,一般指除某一明显而稳定的特征外,其余鉴定特征都与模式种相同的种。

(4)变种:与亚种是同义词,现在已很少使用。

(5)菌群:包括两种微生物和介于他们之间的一些过渡类型的菌种,具有某些共同性状。如大肠菌群包括大肠杆菌、产气肠细菌及他们之间的过渡类型。

(6)菌株:指某条件、地区分离得到的具体菌株。它是由一个独立分离的单细胞系培养而成的纯遗传型群体及其一切后代。

菌株命名形式:属名+种名+菌株代号,菌株代号可随意用字母、符号、编号或字母加编号等自由决定,如:

大肠杆菌K12菌株:Escherichia coli K12;

大肠杆菌O157:H7菌株:Escherichia coli O157:H7。

(7)菌型:曾用作菌株的同义词,现已废除,仅作若干变异型的后缀。

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